Microbiota bacteriana intestinal en pacientes mexicanos con inmunodeficiencia común variable

Gac Med Mex. 2019;155(5):481-486. doi: 10.24875/GMM.19004879.

Abstract

Introduction: Common variable immunodeficiency (CVID) is the main symptomatic primary immunodeficiency and is associated with complex immune disorders. Gut microbiota interacts closely with the immune system, and intestinal dysbiosis is related to multiple diseases.

Objective: To describe for the first time the composition of gut microbiota in Mexican patients with CVID.

Methods: Fecal samples from five patients with CVID were collected and massive sequencing of the V3-V4 region of 16S rRNA gene was carried out using illumina technology.

Results: Bacterial relative abundance was observed at all taxonomic levels. Firmicutes, Actinobacteria and Verrucomicrobia were the predominant phyla. The Clostridia class and the Clostridial order were the most common in their respective taxon; the Ruminococcaceae family predominated. A total of 166 genera were reported, with the most abundant being Faecalibacterium. Five species were identified, but only Bifidobacterium longum was present in all patients.

Conclusions: Unlike healthy subjects' gut microbiota, where Firmicutes and Bacteroidetes predominate, the microbiota of the patients with CVID considered in this study was abundant in Firmicutes, Actinobacteria and Verrucomicrobia. The low presence of Bacteroidetes and high abundance of Firmicutes might indicate the existence of intestinal dysbiosis in these patients.

Introducción: La inmunodeficiencia común variable (IDCV) es la principal inmunodeficiencia primaria sintomática y cursa con alteraciones inmunes complejas. La microbiota intestinal interactúa estrechamente con el sistema inmune y la disbiosis intestinal está relacionada con múltiples patologías.

Objetivo: Describir por primera vez la composición de la microbiota intestinal en pacientes mexicanos con inmunodeficiencia común variable.

Método: Se recolectaron muestras fecales de cinco pacientes con inmunodeficiencia común variable y se llevó a cabo secuenciación masiva de la región V3-V4 del gen 16S rRNA mediante tecnología Illumina.

Resultados: Se observó abundancia bacteriana relativa a todos los niveles taxonómicos. Firmicutes, Actinobacteria y Verrucomicrobia fueron los filos predominantes. La clase Clostridia y el orden Clostridiales fueron los principales en su respectivo taxón; predominó la familia Ruminococcaceae. Se reportaron 166 géneros, el más abundante fue Faecalibacterium. Se identificaron cinco especies, pero solo Bifidobacterium longum estuvo presente en todos los pacientes.

Conclusiones: A diferencia de la microbiota intestinal de sujetos sanos en quienes predominan Firmicutes y Bacteroidetes, en los pacientes con inmunodeficiencia común variable considerados en este estudio fueron abundantes Firmicutes, Actinobacterias y Verrucomicrobia. La baja abundancia de bacteroidetes y alta de firmicutes podrían significar disbiosis intestinal.

Keywords: 16S rRNA; Common variable immunodeficiency; Disbiosis; Dysbiosis; Firmicutes; Gut microbiota; Inmunodeficiencia común variable; Microbiota intestinal.

MeSH terms

  • Actinobacteria / isolation & purification
  • Bacteria / classification
  • Bacteroidetes / isolation & purification
  • Common Variable Immunodeficiency / microbiology*
  • Dysbiosis / microbiology*
  • Feces / microbiology
  • Firmicutes / isolation & purification
  • Gastrointestinal Microbiome*
  • Humans
  • Mexico
  • RNA, Ribosomal, 16S / genetics
  • Verrucomicrobia / isolation & purification

Substances

  • RNA, Ribosomal, 16S