Molecular characteristics of canine parainfluenza viruses type 5 (CPIV-5) isolated in Korea

Can J Vet Res. 2015 Jan;79(1):64-7.

Abstract

Three canine parainfluenza viruses type 5 (CPIV-5) were isolated from lung tissues of 3 Korean dogs with mild pneumonia between 2008 and 2009. The isolates were fully sequenced and compared with published reference sequences. The size of the genome was 15 246 nucleotides long and no remarkable differences were found when compared with previously published reference sequences. In phylogenetic analysis based on the F and P genes, parainfluenza virus 5 (PIV-5) strains were divided into at least 3 subgroups. Three CPIV-5 strains were clustered with CPIV-5 T1, H22 and 78524 strains. All PIV-5 strains were independent of the host species, geographical distribution, and the isolated period.

Trois virus parainfluenza canins de type 5 (CPIV-5) furent isolés entre 2008 et 2009 à partir de tissu pulmonaire de trois chiens coréens souffrant de pneumonie légère. Les isolats furent complètement séquencés et comparés à des séquences de référence publiées. La taille du génome était de 15 246 nucléotides de longueur et aucune différence notable ne fut trouvée lorsque comparé avec les séquences de référence. Lors d’analyses phylogénétiques basées sur les gènes F et P, les souches de virus parainfluenza de type 5 (PIV-5) furent séparées en au moins trois sous-groupes. Les trois souches de CPIV-5 étaient regroupées avec les souches de CPIV-5 T1, H22 et 78524. Toutes les souches de PIV-5 étaient indépendantes de l’espèce hôte, de la distribution géographique et de la période à laquelle elles furent isolées.(Traduit par Docteur Serge Messier).

Publication types

  • Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

  • Animals
  • Base Sequence
  • DNA, Viral / analysis
  • Dog Diseases / virology*
  • Dogs
  • Molecular Sequence Data
  • Parainfluenza Virus 5 / genetics*
  • Parainfluenza Virus 5 / isolation & purification
  • Phylogeny
  • Republic of Korea
  • Rubulavirus Infections / veterinary*
  • Rubulavirus Infections / virology
  • Sequence Analysis, DNA

Substances

  • DNA, Viral

Associated data

  • GENBANK/KC237063
  • GENBANK/KC237064
  • GENBANK/KC237065